En el mismo lugar del registro... HKEY_CURRENT_USER\Control Panel\Desktop
encontraras una clave (y si no, la creas) llamada CursorBlinkRate.
Dándole el valor -1 harás que el cursor no parpadee. Puedes indicar un valor mayor para que parpadee mas rápido.
Hay que reiniciar aunque es mas fácil hacerlo desde el panel de control icono de teclado...